Так екс-прем’єр Віталій Масол вважає, що до вбивства Щербаня причетний президент Віктор Янукович. Допитати главу держави у справі Щербаня Генпрокуратуру закликали ще у червні минулого року. Відповідну заяву тоді оголосила фракція «БЮТ-«Батьківщина»». Втім згодом у соцмережах з'явилося повідомлення, написане ніби від імені Віталія Масола, в якому він заперечував свої обвинуваченя на адресу президента. Допитати Януковича, а також генерального прокурора Віктора Пшонку рекомендував і захисник Тимошенко Сергій Власенко.
Водночас бізнес-партнер Євгена Щербаня Юрій Дєдух заявляв, що вбивство депутата замовили Павло Лазаренко і Леонід Кучма. За його словами, вбивство не могло відбутися без відома Кучми.
У свою чергу колишній адвокат засудженого за вбивство Євгена Щербаня Дмитро Поїзд вважає, що у справі про вбивство Євгена Щербаня потрібно допитати народного депутата Ріната Ахметова.
А захист Тимошенко просив Генеральну прокуратуру розслідувати можливе замовлення вбивства Євгена Щербаня бізнес-партнером і помічником тодішнього прем'єра Павла Лазаренка Петром Кириченком.
Також захист Тимошенко вважає за доцільне перевірити версію про причетність до вбивства Євгена Щербаня колишнього голови Донецької обласної державної адміністрації Володимира Щербаня.
Народний депутат від «Батьківщини» Олександра Кужель стверджувала, що після зняття з посади у Володимира Щербаня виник конфлікт з Євгеном Щербанем. За її словами, Володимир Щербань обурювався лобіюванням Євгеном Щербанем призначення Євгена Марчука на посаду керівника фракції «Соціально-ринковий вибір». Як розповідала Кужель, коли Євген Щербань заявив, що на виборах президента він підтримає Марчука, Володимир Щербань «взбєлєнілся і вийшов з партії».
Водночас Кужель вважає, що вбивство Євгена Щербаня у 1996 році могли організувати тільки спецслужби.