Євген Прусенко обіймав посаду заступника голови Укравтодору від червня 2010 року.
Згідно з інформацією Укравтодору, Прусенко народився 3 листопада 1956 в місті Горлівка, Донецької області.
Має науковий ступінь кандидата технічних наук. З 1997 до 2001 року був завідувачем кафедри будівництва та експлуатації автодоріг Харківського автомобільно-дорожнього інституту,
З 2001 працював начальником управління науково-технічної політики Державної служби автомобільних доріг України, з 2006 року став заступником голови Держслужби.
Як відомо, попередній керівник Укравтодору Володимир Демішкан був обраний до Верховної Ради та залишив свою посаду в листопаді 2012 року.