Відповідно до указу, у структурі апарату РНБО створено департаменти державної безпеки і правоохоронної діяльності, військової безпеки, економічної та соціальної безпеки, зовнішньополітичних аспектів національної безпеки.
Також у структурі апарату РНБО створено контрольне управління, організаційно-технічне управління, відділ бухгалтерського обліку і звітності, режимно-секретний сектор.
У структурі залишилися юридичний відділ, відділ кадрів, відділ забезпечення доступу до публічної інформації, служба секретаря РНБО.
Скасовано управління експертно-аналітичного забезпечення, координаційної та адміністративної роботи і організаційного забезпечення, фінансово-економічний відділ, відділ документообігу і архівів, сектор контролю виконання актів Президента.
Кількість заступників секретаря РНБО залишився колишнім – один перший заступник і два заступники.
Нагадаємо, у квітні 2011 року Янукович реорганізував структуру апарату РНБО, скоротивши її штат до 90 осіб, і, замість раніше існуючих 9 департаментів, створив у структурі органа 3 управління: експертно-аналітичного забезпечення, координаційної та адміністративної роботи і організаційного забезпечення.
У лютому 2012 року секретар РНБО Андрій Клюєв оголосив про плани розширення штату Ради національної безпеки та оборони.