Аністратенко користувався особливою довірою прем'єр-міністра Миколи Азарова. Він готував практично всі наради, які проводив глава уряду, виробляв варіанти рішень спірних питань, які виникають між міністерствами і різними органами влади. У його обов'язки також входила підготовка документів на підпис до прем'єра.
Як стверджує джерело, заслужений будівельник України Аністратенко також був потрібним і корисним для Азарова експертом у сфері будівництва та нерухомості.
Крім того, за даними, отриманими від джерела в Кабінеті міністрів, півтора тижні тому – 14-15 серпня правоохоронці провели обшуки вдома і в робочому кабінеті Аністратенка.
Варто зазначити, що під час відпустки Азарова, коли його обов'язки виконував перший віце-прем'єр Сергій Арбузов, між секретаріатом прем'єра і в.о. міністра Кабінету міністрів Владиславом Забарським стався конфлікт. Забарський наполягав на тому, щоб відсторонити секретаріат Азарова від підготовки засідань Кабінету міністрів під головуванням Арбузова і документів, які на них виносилися.
Аністратенко був призначений на посаду першого заступника керівника секретаріату Кабінету міністрів 11 квітня 2011 року. До цього він майже рік обіймав посаду заступника міністра Кабінету міністрів України.